Dalam upaya meningkatkan mutu pendidikan sekaligus pengembangan institusi dalam menyelenggarakan proses pendidikan di Stikes Ngudi Waluyo maka pihak stikes telah menjalin kerjasama dengan pihak lain seperti UNISULA, UNDIP, UNNES melaui perjanjian MOU dalam hal proses PBM.

Disamping itu STIKES NGUDI WALUYO UNGARAN juga menjalin kerjasama dengan rumah sakit seperti RS. Dr. Kariadi,RS Tidar Magelang, RSUD. Ungaran, RSUD Ambarawa,RSU, Surakarta.Kerjasama ini dilaksanakan untuk menunjang praktik mahasiswa di lapangan.

Pada tahun 2006 Stikes Ngudi Waluyo juga berusaha mengembangkan kerjasama dengan pihak luar negeri.Seperti kerjasama dengan pihak :

• Kementrian Diraja Malaysia dalam hal recrutment lulusan perawat Stikes Ngudi Waluyo untuk bekerja di malaysia.
• Australlian Businnes Volunteers (ABV )dalam hal peningkatan penguasaan Bahasa Inggris bagi Mahasiswa dan Staff pengajar di lingkungan Stikes Ngudi waluyo.